澤州縣食品藥品監督管理局始建于2002年4月，其前身為“晉城市藥品監督管理局澤州分局”。因職能轉換，于2005年1月31日掛牌成立“晉城市食品藥品監督管理局澤州分局”。2009年12月，由省以下垂直管理改制為地方政府管理。之后，掛牌成立“澤州縣食品藥品監督管理局”，正科級建制，為政府組成部門。2013年，澤州縣食品藥品監督管理局重新組建完成后，承擔澤州縣域內食品流通、餐飲服務環節許可和食品（生產、流通、餐飲服務環節和保健食品）、化妝品、藥品、醫療器械的監督管理以及藥品研制生產使用全過程監督的職責，為獨立行政執法主體，加掛澤州縣食品安全委員會辦公室牌子。內設辦公室﹑食品安全監管股、食品市場監管股、藥械綜合監管股和保健食品化妝品監管股五個股室。下設食品藥品稽查隊，加掛食品藥品投訴舉報中心牌子。行政編制為15名。其中：局長1名、副局長2名，總檢驗師1名。內設機構股級職數5名。工勤人員編制1名。
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